Çocukluktan yetişkinliğe geçiş dönemi olarak tanımlanan ergenlik, otizmli çocukların yaşamlarında belki de en çok ilgiye ihtiyaç duydukları bir dönemdir. Vücut hatlarında, ses tonlarında vb. de değişmeler meydana gelir. Vücuttaki yağ artışından kaynaklanan sivilceler çeşitli sıkıntılar yaşatır. Bu dönemde etiketlenme ve sosyal sorunlar çocukları ve ailelerini önemli ölçüde etkilemektedir. Bu dönemdeki değişimlerden biri de cinsel dürtülerdeki artıştır. Bu dürtüyü nasıl doyuma ulaştıracağını bilemeyen otizmli çocuklarda öfke, saldırganlık, sinir gibi durumlar görülür. Bu durumlarda ilaç tedavisine başlanılan çocuklarda duygusal çöküntü ve içe çekilme gibi yan etkiler görülmektedir. Bundan dolayı ilaç önerilmemektedir. Cinsel eğitime herkesin ihtiyacı olduğu unutulmamalıdır. Çocuklara yaş ve gelişim süreçlerine uygun olarak gereken cinsel eğitim verilmelidir. Otizmli çocuklar bu alanda da ailelerine ve uzmana ihtiyaç duymaktadır. Fizyolojik ve psikolojik birçok değişimin yaşandığı bu dönem kızlarda ortalama 12 erkeklerde ortalama 14 yaşında başlar. Çocuk bu dönemde devamlı kendisini inceler ve değişiklikleri fark eder ve bunlarla nasıl başa çıkacağını bilemeyebilir. Otizmli bireylerin cinsel yaşantıları kısıtlıdır. En çok görülen cinsel deneyim mastürbasyondur. Bununla birlikte karşı cinse sarılma, öpme, koklama, cinsel organına dokunma vb. cinsel yönelimler görülebilir. Otizmli çocuklar uygun yer ve zaman gözetmeden bu davranışları sergileyebilirler. Bu davranışlar uygun yer ve zamanda yapıldığında bir zararı bulunmamaktadır. Mastürbasyonu takıntı haline getiren bireyleri bu takıntıdan kurtarmak gerekir. Bunun içinde yapılacak ilk şey uygun olmayan yerde mastürbasyon yapan çocuğun dikkatini başka yöne çekmektir. Dikkati başka yöne çekilemiyorsa bir uzmandan yardım alınmalıdır.